Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rtn4ip1Q924D0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4ip1Q924D0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms