Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf3Q922U1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf3Q922U1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms