Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb6Q922F4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb6Q922F4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms