Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3bp4Q921I6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Sh3bp4Q921I6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Sh3bp4Q921I6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp4Q921I6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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