Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cts3Q91ZD5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cts3Q91ZD5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms