Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc49Q91YK0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc49Q91YK0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms