Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpm2Q91YD4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpm2Q91YD4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms