Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csde1Q91W50 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms