Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng5Q8VHW4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng5Q8VHW4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms