Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms