Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rhbdd2Q8VEK2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rhbdd2Q8VEK2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rhbdd2Q8VEK2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdd2Q8VEK2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms