Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnrkQ8VDU5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms