Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fyco1Q8VDC1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Fyco1Q8VDC1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fyco1Q8VDC1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms