Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alg12Q8VDB2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alg12Q8VDB2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms