Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5B6

Spsb4, SPRY domain-containing SOCS box protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb4Q8R5B6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spsb4Q8R5B6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spsb4Q8R5B6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms