Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top1mtQ8R4U6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Top1mtQ8R4U6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Top1mtQ8R4U6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1mtQ8R4U6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms