Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2P1

Klhl25, Kelch-like protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl25Q8R2P1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl25Q8R2P1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl25Q8R2P1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms