Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hecw1Q8K4P8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hecw1Q8K4P8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms