Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccm2Q8K2Y9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccm2Q8K2Y9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms