Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stn1Q8K2X3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stn1Q8K2X3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms