Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd3Q8K2F0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd3Q8K2F0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms