Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf3c1Q8K284 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf3c1Q8K284 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms