Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1T0

Tmprss3, Transmembrane protease serine 3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss3Q8K1T0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmprss3Q8K1T0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmprss3Q8K1T0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms