Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rasgef1bQ8JZL7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms