Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LgsnQ8CIX8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms