Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab11fip3Q8CHD8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab11fip3Q8CHD8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip3Q8CHD8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms