Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brf1Q8CFK2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brf1Q8CFK2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brf1Q8CFK2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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