Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Parp11Q8CFF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms