Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Snx8Q8CFD4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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