Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms