Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm16223Q8CBM3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm16223Q8CBM3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm16223Q8CBM3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm16223Q8CBM3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm16223Q8CBM3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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