Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vwc2Q8C8N3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwc2Q8C8N3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms