Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dclre1bQ8C7W7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dclre1bQ8C7W7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dclre1bQ8C7W7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dclre1bQ8C7W7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dclre1bQ8C7W7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dclre1bQ8C7W7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dclre1bQ8C7W7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms