Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8C708 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C708 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C708 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C708 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C708 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C708 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C708 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C708 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C708 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C708 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8C708 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8C708 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8C708 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8C708 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8C708 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8C708 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8C708 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C708 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C708 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C708 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C708 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C708 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C708 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C708 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C708 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C708 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C708 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C708 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C708 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8C708 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8C708 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8C708 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms