Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930504O13RikQ8C5Z9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930504O13RikQ8C5Z9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930504O13RikQ8C5Z9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930504O13RikQ8C5Z9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms