Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc60Q8C4J0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc60Q8C4J0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms