Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccser1Q8C0C4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccser1Q8C0C4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms