Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps6ka5Q8C050 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps6ka5Q8C050 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms