Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYM7

Rsph4a, Radial spoke head protein 4 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph4aQ8BYM7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph4aQ8BYM7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rsph4aQ8BYM7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsph4aQ8BYM7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsph4aQ8BYM7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsph4aQ8BYM7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsph4aQ8BYM7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsph4aQ8BYM7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms