Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Ctdsp2Q8BX07 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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