Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms