Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc12Q8BW49 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc12Q8BW49 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms