Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hirip3Q8BLH7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hirip3Q8BLH7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hirip3Q8BLH7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms