Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
D130040H23RikQ8BII3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
D130040H23RikQ8BII3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
D130040H23RikQ8BII3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms