Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp4f39Q8BGU0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp4f39Q8BGU0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms