Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Vipas39Q8BGQ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Vipas39Q8BGQ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Vipas39Q8BGQ1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Vipas39Q8BGQ1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Vipas39Q8BGQ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Vipas39Q8BGQ1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Vipas39Q8BGQ1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Vipas39Q8BGQ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Vipas39Q8BGQ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Vipas39Q8BGQ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Vipas39Q8BGQ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Vipas39Q8BGQ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vipas39Q8BGQ1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vipas39Q8BGQ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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