Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1l4Q8BGJ9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms