Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH2

Samm50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samm50Q8BGH2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Samm50Q8BGH2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samm50Q8BGH2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms