Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Atg4cQ811C2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Atg4cQ811C2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Atg4cQ811C2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Atg4cQ811C2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Atg4cQ811C2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Atg4cQ811C2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg4cQ811C2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Atg4cQ811C2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Atg4cQ811C2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Atg4cQ811C2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Atg4cQ811C2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Atg4cQ811C2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Atg4cQ811C2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Atg4cQ811C2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Atg4cQ811C2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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