Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms